BIF-4007 Traitement des données biologiques complexes avec Python
Rappel de notions de programmation Python. Familiarisation avec l'application Jupyter Notebook. Manipulation de fichiers et familiarisation avec la librairie Pandas. Calculs scientifiques avec les librairies NumPy et SciPy. Familiarisation avec la librairie BioPython. Interrogation d'une base de données. Visualisation de données avec matplotlib, bokeh et plotly. Calculs statistiques avec StatsModel. Introduction à l'apprentissage machine et aux réseaux de neurones avec scikit-learn et Pytorch. Analyse de réseaux avec NetworkX. Un ordinateur portatif, qui est utilisé régulièrement en classe, est requis pour suivre ce cours.
Responsables
- Faculté des sciences et de génie
- Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique
Cette activité est contributoire dans:
Cours équivalents ou jumelés ULaval
- BIF-7007 Traitement des données biologiques complexes avec Python Depuis l'hiver 2020
Les cours équivalents sont des activités de même cycle dont le contenu est identique ou très semblable. La réussite de l'un signifie la reconnaissance de l'autre.
Les cours jumelés sont des activités de cycles différents. L'étudiant qui a suivi le cours de niveau 4000 ne peut pas suivre le cours correspondant de niveau 6000 ou 7000 s'il poursuit des études au 2e ou au 3e cycle et il ne peut pas demander à la direction de son programme de le reconnaître.
Cette page constitue la description officielle de cette activité. L'Université Laval se réserve le droit de modifier l'activité sans préavis. Tous les horaires indiqués sont sujets à changement.
Répartition hebdomadaire
- 3h Cours
- 0h Laboratoire ou travaux pratiques
- 6h Travail personnel
- 9h Total
Horaire
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Automne 2022 – 1 section offerte
NRC 90987 Capacité maximale: 40 étudiants Enseignant: Elsa Marie Suzanne Rousseau
Plage horaire
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- Type: En classe
- Dates: Du 6 sept. 2022 au 16 déc. 2022
- Journée: Mercredi
- Horaire: De 13h30 à 16h20