Projets de recherche

Conception et implémentation de la robotisation d'un microscope de criblage à haut débit (maîtrise ou doctorat)

Description du projet

Le projet consiste à effectuer la conception et l'implantation de la robotisation d'un microscope de criblage à haut débit développé à l'interne ainsi que de la gestion de ses données massives dans le but de bâtir une plateforme de phénotypage cellulaire dédiée à l'identification de biomarqueurs de diverses maladies du système nerveux. L'objectif principal est de répondre aux exigences des protocoles expérimentaux complexes et diversifiés qui devront être réalisés sur la plateforme de phénotypage à l'aide de solutions matérielles et logicielles. De plus, une gestion saine et efficace des données massives produites par le microscope de criblage à haut débit devra être mise au point.

Le cœur de la plateforme de criblage à haut débit est un microscope holographique numérique (DHM), un appareil qui permet de faire des mesures quantitatives de phase sur des échantillons transparents ou semi-transparents, sans nécessiter l'utilisation d'agent de contraste et avec une très faible puissance d'éclairage. L'intégration de composantes externes et leur automatisation est cependant nécessaire pour obtenir une configuration et une géométrie adaptée à l'étude des cellules vivantes. Un laser super-continuum, une platine de déplacement d'échantillon, une enceinte environnementale contrôlant la température, une chambre d'imagerie régissant les gaz, un système de perfusion, un module de fluorescence et un système d'électrophysiologie seront intégrés en un seul et même système fonctionnel.

L'étudiant devra concevoir et implémenter un système de synchronisation et de contrôle des tous ces éléments. Le projet fera intervenir un microcontrôleur ou une carte d'acquisition pour gérer l'électronique des signaux de déclenchement et un logiciel de synchronisation pour orchestrer l'ensemble des tâches. Ce logiciel devra permettre aux utilisateurs de facilement concevoir, tester et utiliser plusieurs protocoles expérimentaux complexes et diversifiés. En plus du logiciel de synchronisation, un logiciel de traitement d'images en temps réel sera développé afin de permettre aux usagers de visualiser les phénomènes biologiques enregistrés pendant l'acquisition. Également, une procédure pour la gestion saine et efficace des données massives produites par le microscope de criblage à haut débit devra être mise au point. Finalement, le projet comporte une facette de validation de la solution proposée au laboratoire via une étroite collaboration avec les différents usagers de la plateforme de phénotypage.

Domaines de recherche

- Microscopie holographique numérique
- Techniques de microscopie optique non conventionnelles
- Imagerie de phase quantitative
- Interférométrie
- Biophysique
- Tomographie par diffraction optique
- Imagerie computationnelle
- Microscopie super-résolution

Directeur de recherche

Pierre Marquet

Milieu de recherche

Laboratoire de recherche en neurophotonique et psychiatrie

Le laboratoire du professeur Marquet, dans le cadre du Programme de chaires d'excellence en recherche du Canada (https://www.cerc.gc.ca), a lancé un programme performant visant à modéliser la composante de développement neurologique des grandes maladies psychiatriques telles que la schizophrénie, les troubles bipolaires et les troubles dépressifs majeurs, faisant appel aux cellules souches pluripotentes induites (iPSCs) dérivées de patients. L'objectif principal de cette recherche est de mieux comprendre la pathogénie de ces maladies débilitantes pour lesquelles il n'existe que des traitements palliatifs. Le laboratoire du professeur Marquet est situé au centre de recherche CERVO, l'un des principaux centres de neuroscience et de santé mentale au Canada, qui se concentre sur les causes profondes des maladies du cerveau. Le centre regroupe une soixantaine de chercheurs responsables d'équipes de recherche de plus de 400 personnes et offre une expertise multidisciplinaire allant de la biophysique des membranes à l'intervention sociale, en passant par la psychologie de la cognition (https://cervo.ulaval.ca).

Site web


Programmes d’études associés

Doctorat en biophotonique

Description du programme

Soutien financier disponible*

Financement en lien avec le projet de recherche

20000$ par année pendant 5 années.

Financement en lien avec le programme d'études

Bourses de réussite

Étapes
Prime 
Prime de progression
7 x 500$
Examen doctoral ou séminaire de présentation 750$
Examen doctorat, séminaire ou conférence
1 000$
Publication
750$
Communication
1 000$
Dépôt initial
1 000$*
Total 8 500$

* Un bonus de 500 $ sera ajouté à la prime à la diplomation si le dépôt initial est effectué avant la session qui précède la session maximale d’admissibilité.

Financement en lien avec l'Université Laval

Sources de financement Montant
Bourse d’admission au doctorat de l’Université Laval  2 000$
Bourses de leadership et développement durable 
3 x 10 000$
Bourse de mobilité Stage Hors-Québec  1 000$
Bourse d’études supérieures des organismes subventionnaires     21 000$ à 50 000$
Répertoire électronique des bourses de troisième cycle 500$ à 50 000$

Programme de bourses d’exemption des droits de scolarité supplémentaires pour étudiants étrangers: bourse permettant à un candidat étranger de payer les mêmes droits de scolarité qu’un candidat canadien, ce qui représente une économie globale d’environ 30 000$. À noter que ceux qui bénéficient de ce programme ne recevrons pas la bourse d'admission au doctorat directement. Votre bourse sera intégrée au Programme d'exemption des droits de scolarité majorés afin de vous permettre de payer le tarif québécois.

* Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.

Doctorat en génie électrique

Description du programme

Soutien financier disponible*

Financement en lien avec le projet de recherche

20000$ par année pendant 5 années.

Financement en lien avec le programme d'études

Bourses de réussite

Étapes
Prime 
Prime de progression
7 x 500$
Examen doctoral ou séminaire de présentation 750$
Examen doctorat, séminaire ou conférence
1 000$
Publication
750$
Communication
1 000$
Dépôt initial
1 000$*
Total 8 500$

* Un bonus de 500 $ sera ajouté à la prime à la diplomation si le dépôt initial est effectué avant la session qui précède la session maximale d’admissibilité.

Financement en lien avec l'Université Laval

Sources de financement Montant
Bourse d’admission au doctorat de l’Université Laval  2 000$
Bourses de leadership et développement durable 
3 x 10 000$
Bourse de mobilité Stage Hors-Québec  1 000$
Bourse d’études supérieures des organismes subventionnaires     21 000$ à 50 000$
Répertoire électronique des bourses de troisième cycle 500$ à 50 000$

Programme de bourses d’exemption des droits de scolarité supplémentaires pour étudiants étrangers: bourse permettant à un candidat étranger de payer les mêmes droits de scolarité qu’un candidat canadien, ce qui représente une économie globale d’environ 30 000$. À noter que ceux qui bénéficient de ce programme ne recevrons pas la bourse d'admission au doctorat directement. Votre bourse sera intégrée au Programme d'exemption des droits de scolarité majorés afin de vous permettre de payer le tarif québécois.

* Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.

Doctorat en informatique

Description du programme

Soutien financier disponible*

Financement en lien avec le projet de recherche

20000$ par année pendant 5 années.

Financement en lien avec le programme d'études

Bourses de réussite

Étapes
Prime 
Prime de progression
7 x 500$
Examen doctoral ou séminaire de présentation 750$
Examen doctorat, séminaire ou conférence
1 000$
Publication
750$
Communication
1 000$
Dépôt initial
1 000$*
Total 8 500$

* Un bonus de 500 $ sera ajouté à la prime à la diplomation si le dépôt initial est effectué avant la session qui précède la session maximale d’admissibilité.

Financement en lien avec l'Université Laval

Sources de financement Montant
Bourse d’admission au doctorat de l’Université Laval  2 000$
Bourses de leadership et développement durable 
3 x 10 000$
Bourse de mobilité Stage Hors-Québec  1 000$
Bourse d’études supérieures des organismes subventionnaires     21 000$ à 50 000$
Répertoire électronique des bourses de troisième cycle 500$ à 50 000$

Programme de bourses d’exemption des droits de scolarité supplémentaires pour étudiants étrangers: bourse permettant à un candidat étranger de payer les mêmes droits de scolarité qu’un candidat canadien, ce qui représente une économie globale d’environ 30 000$. À noter que ceux qui bénéficient de ce programme ne recevrons pas la bourse d'admission au doctorat directement. Votre bourse sera intégrée au Programme d'exemption des droits de scolarité majorés afin de vous permettre de payer le tarif québécois.

* Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.

Doctorat en physique

Description du programme

Soutien financier disponible*

Financement en lien avec le projet de recherche

20000$ par année pendant 5 années.

Financement en lien avec le programme d'études

Bourses de réussite

Étapes
Prime 
Prime de progression
7 x 500$
Examen doctoral ou séminaire de présentation 750$
Examen doctorat, séminaire ou conférence
1 000$
Publication
750$
Communication
1 000$
Dépôt initial
1 000$*
Total 8 500$

* Un bonus de 500 $ sera ajouté à la prime à la diplomation si le dépôt initial est effectué avant la session qui précède la session maximale d’admissibilité.

Financement en lien avec l'Université Laval

Sources de financement Montant
Bourse d’admission au doctorat de l’Université Laval  2 000$
Bourses de leadership et développement durable 
3 x 10 000$
Bourse de mobilité Stage Hors-Québec  1 000$
Bourse d’études supérieures des organismes subventionnaires     21 000$ à 50 000$
Répertoire électronique des bourses de troisième cycle 500$ à 50 000$

Programme de bourses d’exemption des droits de scolarité supplémentaires pour étudiants étrangers: bourse permettant à un candidat étranger de payer les mêmes droits de scolarité qu’un candidat canadien, ce qui représente une économie globale d’environ 30 000$. À noter que ceux qui bénéficient de ce programme ne recevrons pas la bourse d'admission au doctorat directement. Votre bourse sera intégrée au Programme d'exemption des droits de scolarité majorés afin de vous permettre de payer le tarif québécois.

* Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.

Maîtrise en biophotonique - avec mémoire

Description du programme

Soutien financier disponible*

Financement en lien avec le projet de recherche

17000$ par année pendant 2 années.

Financement en lien avec le programme d'études

Bourses de réussite

Étapes Prime
Activité évaluée
650$
Prime à l'excellence
1 000$
Total 1 650$

Financement en lien avec l'Université Laval

Sources de financement Montant
Bourses de leadership et développement durable 2 x 5 000$
Bourse de mobilité Stage Hors-Québec
1 000$
Bourses d’études supérieures des organismes subventionnaires
14 100$ à 21 000$
Répertoire électronique des bourses de deuxième cycle
500$ à 50 000$

Bourses d'excellence à la réussite pour les étudiants internationaux: Plusieurs programmes sont admissibles aux bourses d'excellence à la maîtrise pour les étudiants de l'Afrique et d'Europe excluant la France. Cette bourse d'une valeur annuelle de 7000$ est attribuée selon des critères d'excellence universitaire. * Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.

Maîtrise en génie électrique - avec mémoire

Description du programme

Soutien financier disponible*

Financement en lien avec le projet de recherche

17000$ par année pendant 2 années.

Financement en lien avec le programme d'études

Bourses de réussite

Étapes Prime
Activité évaluée
650$
Prime à l'excellence
1 000$
Total 1 650$

Financement en lien avec l'Université Laval

Sources de financement Montant
Bourses de leadership et développement durable 2 x 5 000$
Bourse de mobilité Stage Hors-Québec
1 000$
Bourses d’études supérieures des organismes subventionnaires
14 100$ à 21 000$
Répertoire électronique des bourses de deuxième cycle
500$ à 50 000$

Bourses d'excellence à la réussite pour les étudiants internationaux: Plusieurs programmes sont admissibles aux bourses d'excellence à la maîtrise pour les étudiants de l'Afrique et d'Europe excluant la France. Cette bourse d'une valeur annuelle de 7000$ est attribuée selon des critères d'excellence universitaire. * Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.

Maîtrise en informatique - avec mémoire

Description du programme

Soutien financier disponible*

Financement en lien avec le projet de recherche

17000$ par année pendant 2 années.

Financement en lien avec le programme d'études

Bourses de réussite

Étapes Prime
Activité évaluée
650$
Prime à l'excellence
1 000$
Total 1 650$

Financement en lien avec l'Université Laval

Sources de financement Montant
Bourses de leadership et développement durable 2 x 5 000$
Bourse de mobilité Stage Hors-Québec
1 000$
Bourses d’études supérieures des organismes subventionnaires
14 100$ à 21 000$
Répertoire électronique des bourses de deuxième cycle
500$ à 50 000$

Bourses d'excellence à la réussite pour les étudiants internationaux: Plusieurs programmes sont admissibles aux bourses d'excellence à la maîtrise pour les étudiants de l'Afrique et d'Europe excluant la France. Cette bourse d'une valeur annuelle de 7000$ est attribuée selon des critères d'excellence universitaire. * Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.

Maîtrise en physique - avec mémoire

Description du programme

Soutien financier disponible*

Financement en lien avec le projet de recherche

17000$ par année pendant 2 années.

Financement en lien avec le programme d'études

Bourses de réussite

Étapes Prime
Activité évaluée
650$
Prime à l'excellence
1 000$
Total 1 650$

Financement en lien avec l'Université Laval

Sources de financement Montant
Bourses de leadership et développement durable 2 x 5 000$
Bourse de mobilité Stage Hors-Québec
1 000$
Bourses d’études supérieures des organismes subventionnaires
14 100$ à 21 000$
Répertoire électronique des bourses de deuxième cycle
500$ à 50 000$

Bourses d'excellence à la réussite pour les étudiants internationaux: Plusieurs programmes sont admissibles aux bourses d'excellence à la maîtrise pour les étudiants de l'Afrique et d'Europe excluant la France. Cette bourse d'une valeur annuelle de 7000$ est attribuée selon des critères d'excellence universitaire. * Présentation du soutien financier maximal disponible. Certaines conditions s'appliquent. Sujet à changement sans préavis. Pour plus d'information, renseignez-vous auprès des organismes responsables.

Profil recherché

- Informatique
- Physique
- Génie électrique
- Génie chimique
- Génie physique

Documents exigés

- Curriculum vitæ
- Relevé de notes

Date limite pour postuler

30 août 2020

Pour plus d'information

Hélène Leblond
Gestionnaire de recherche
Centre de recherche CERVO
helene.leblond.3@ulaval.ca